Magesår er det som på fagspråket kalles ulcus ventrikulus, og når det oppstår i duodenum, ulcus duodeni. Magesår oppstår som følge av syren i magesekken, og slike sår kan medføre betennelse og i verste fall gi peritonitt (betennelse i buken) eller blødninger.
Det viser seg at en stor del av skylden for magesår skyldes bakterien Helicobacter pylori. Denne bakterien hemmer syreproduksjonen, produserer ammoniakk og skiller ut en rekke stoffer som ødelegger epitelceller og bindingene mellom epitelcellene i magesekken. Det medfører at man lettere får sår i vevet. Behandling av magesår skjer ved hjelp av antibiotika.
Gastritt er betennelse i slimhinnene i magesekken. Også denne tilstanden kan utløses av bakterien H. pylori, men også av mange andre faktorer, deriblant visse typer mat og overdreven bruk av alkohol.