Ettersom magesekken inneholder en ekstremt sur magesaft, med pH ned mot 1,5, forstår vi at vi må ha en kraftig barriere i magesekken for å beskytte oss selv mot denne syren. Mukosabarrierer sørger for denne beskyttelsen. Den danner et tykt slimlag som inneholder bikarbonat (HCO3-). Bikarbonat kan binde opp syremolekyler og nøytralisere dem. I tillegg har vi, mellom cellene i magesekken, det vi kaller for «tight junctions» – tette bindinger. Disse sørger for at vi ikke har noen lekkasje av magesaft ut av magesekken mellom epitelcellene. Videre, på grunn av syrens slitasje på magesekkens vev, har vi en kontinuerlig utskifting av celler i magesekken, hver 3.- 6. dag.